Cardiobiome

Diseño y Desarrollo de una plataforma para estudiar el Microbioma como biomarcador en medicina personalizada.

Infarto como Prueba de concepto

Este proyecto se centra en la aplicación del Microbioma en Medicina Personalizada: el microbioma de cada persona es algo característico que influye en los estados de salud y enfermedad y en la respuesta a tratamientos. Es un proyecto innovador centrado en el análisis del microbioma de sangre en patologías importantes para usarlo como biomarcador utilizable en la prevención, la clasificación, el diagnóstico y el tratamiento de estas patologías.

El grado de innovación del proyecto es enorme ya que es muy novedoso utilizar el microbioma de sangre como biomarcador y además hay muchas tecnologías innovadoras de las que más están impactando en el área de salud que están implicadas en este proyecto:

• El estudio del Microbioma
• Las tecnologías de secuenciación masiva NGS
• La computación en la nube para manejo de Big Data
• La genómica y la bioinformática en Medicina personalizada
• Los nuevos modelos de Historia clínica Electrónica y su relación con la Medicina personalizada

La integración de todos estos aspectos con el fin de conseguir la aplicación del microbioma como biomarcador en la clínica es en sí innovadora.

La utilización de visualizaciones interactivas para la interpretación es otro aspecto innovador del proyecto.

Objetivos del Proyecto

En los últimos años han sido numerosos los trabajos de investigación que apoyan la gran relevancia del microbioma en la salud humana. Por otro lado, las nuevas tecnologías de secuenciación masiva permiten explorar el microbioma humano de forma intensiva y a bajo coste. Estas 2 razones hacen viable y de enorme interés la utilización en clínica del microbioma como un biomarcador polivalente con inmensas posibilidades en la medicina personalizada.

Como prueba de concepto del microbioma como biomarcador y considerando también que las muestras de sangre son las más habituales en el diagnóstico clínico, decidimos estudiar la posible relación entre el microbioma en sangre y una patología muy importante, el infarto agudo. Dado que se han detectado bacterias en las placas de ateroma y que en muchas publicaciones se detectan bacterias en sangre, incluso en individuos sanos, pensamos que el análisis del microbioma de muestras de pacientes en varios puntos de su evolución desde el momento del infarto podría abrir la posibilidad de usar el perfil de bacterias como biomarcador específico de la evolución del infarto.  Por otro lado, la demostrada relación entre periodontitis e infarto nos llevó a decidir analizar también el microbioma de la boca tratando de ver si las bacterias detectadas en sangre eran las mismas que las detectadas en la boca definiendo así su vía de entrada.

En este proyecto vamos a desarrollar las herramientas informáticas para obtener una historia clínica para datos de microbioma y una plataforma bioinformática de análisis de secuencias del microbioma para facilitar su uso por parte de los profesionales clínicos. Visualizaciones avanzadas que faciliten la interpretación de los datos del microbioma hasta convertirlo en una tarea sencilla es otro objetivo del proyecto.

Este proyecto se centra en la aplicación del Microbioma en Medicina Personalizada: el microbioma de cada persona es algo característico que influye en los estados de salud y enfermedad y en la respuesta a tratamientos. Es un proyecto innovador centrado en el análisis del microbioma de sangre en patologías importantes para usarlo como biomarcador utilizable en la prevención, la clasificación, el diagnóstico y el tratamiento de estas patologías.

Principales objetivos

• Descubrir la relación entre el microbioma bacteriano y el infarto
• Descubrir nuevos biomarcadores de enfermedades basados en el microbioma de sangre
• Diseñar, desarrollar e implementar las herramientas bioinformáticas y de visualización para la interpretación de los datos del microbioma
• Estandarizar todo el proceso desde la muestra hasta el análisis para que el microbioma pueda utilizarse como biomarcador en Medicina personalizada. El microbioma como biomarcador en infarto sería la prueba de concepto.

Integración de los datos del microbioma con la historia clínica electrónica del paciente para hacer real la integración del microbioma en la práctica clínica dentro de las nuevas tendencias de la medicina de precisión y la medicina personalizada.

Participantes: AYESA, ERA7, HEALTH IN CODE, LORGEN

ORGANISMO FINANCIADOR: CDTI

CONVOCATORIA DEL AÑO 2015 DEL PROGRAMA FEDER INNTERCONECTA

Nº de Identificación del expediente: EXP – 00083294 / ITC-20151148

Acrónimo del proyecto: CARDIOBIOME